Amazon FBAを活用した販売では、売上や広告費に注目が集まりがちですが、見落とされやすいのが「FBA保管料」です。在庫を持つだけで毎月発生する保管料は、在庫設計を誤ると利益やキャッシュフローを静かに圧迫します。
特に企業でAmazonを運用する企業の場合、SKU数やロットが大きくなりやすく、保管料の影響は無視できません。加えて2024年5月以降は「FBA在庫保管追加手数料」「低在庫レベル手数料」が導入され、2025年4月にも長期在庫追加手数料が改定されるなど、保管コストはここ数年で複雑化しています。
本記事では、Amazon FBA保管料の仕組みや種類、具体的な計算式・料金表、セラーセントラルでの確認方法を整理したうえで、無駄なコストを抑えるための在庫管理戦略と実践的な改善プロセスを解説します。
Contents
Amazon FBA保管料とは？
Amazon FBA保管料とは、FBA倉庫に商品を保管することで発生するコストを指します。FBAは物流業務をAmazonに任せられる一方で、在庫量や保管期間に応じて保管料が継続的に発生します。
法人がAmazonを運用する場合、この保管料は利益やキャッシュフローに直結するため、仕組みを正しく理解したうえで戦略的に管理することが重要です。
Amazon FBAの仕組みと保管料が発生する理由
Amazon FBAは、出品者が商品をAmazonのフルフィルメントセンターへ納品することで、保管、梱包、配送、カスタマー対応までをAmazonが代行する仕組みです。この物流インフラを維持するため、Amazonでは倉庫スペースの使用量に応じた保管料を設定しています。
保管料は単に「置いている期間」に対する費用ではなく、倉庫の回転率や運用効率を保つための調整コストという側面を持ちます。
そのため、在庫が増えすぎたり、売れ行きが鈍化して長期間滞留したりすると、出品者側の負担が大きくなる設計です。
Amazon FBAで発生する3種類の保管料
Amazon FBAでは、在庫の状態や保管期間、運用状況に応じて複数の保管料が発生します。代表的なのが月額で必ず発生する在庫保管手数料に加え、一定期間を超えた在庫にかかる長期在庫保管手数料、さらに在庫パフォーマンス悪化時に発生する保管超過手数料です。
これらを正しく区別して把握することが、コスト管理の第一歩となります。
FBA在庫保管手数料（月額保管料）の仕組み
FBA在庫保管手数料は、FBA倉庫に保管されているすべての商品を対象に、毎月発生する基本的な保管料です。この手数料は商品サイズや保管体積をもとに算出され、2025年5月にも料金体系が改訂されました。改訂後も、在庫量が多いほどコストが増える構造は変わっておらず、特に計画性のない在庫積み上げは利益を圧迫する要因となります。
また、FBA在庫保管手数料は季節によっても変動し、年末商戦などの繁忙期は通常期よりも料金が高く設定されています。具体的には、通常期（1〜9月）と比べて繁忙期（10〜12月）は単価がおおむね2倍前後になるため、繁忙期をまたいで在庫を持ち越すと、想定以上に保管コストが増える可能性があります。売上予測と連動した在庫設計を行い、月額保管料を固定費として捉えた管理が求められます。
関連記事：Amazonせどりの在庫管理はこれで完璧！無料ツールからFBA連携まで解説
FBA長期在庫保管手数料（271日以上）の影響
FBA長期在庫保管手数料は、FBA倉庫に271日以上保管されている在庫を対象に発生する追加コストです。毎月15日時点の在庫が評価対象となり、保管期間に応じて段階的に手数料が引き上がっていく仕組みのため、該当するとコスト負担が一気に増加します。
特に2025年4月15日の改定では、保管期間が365日を超える在庫に対する長期在庫追加手数料が引き上げられました。1年以上売れない在庫を抱えると、月額保管料の数倍〜十数倍のコストが上乗せされるケースもあるため、長期保管化の前に意思決定を行うことが重要です。
長期在庫保管手数料の特徴は、売上が立たない在庫ほど負担が重くなる点です。特にニッチな商品は販売頻度が低くなりやすく、「いずれ売れるだろう」と判断を先送りにすると、気づかないうちにキャッシュフローを圧迫します。そのため、271日という基準を一つの判断ラインとし、返送や処分、販路切り替えを含めた意思決定を行うことが重要です。
FBA在庫保管超過手数料（在庫パフォーマンス低下時）
FBA在庫保管超過手数料は、在庫パフォーマンス指標（IPI）が一定水準を下回った場合に発生する手数料です。これは在庫量だけでなく、在庫回転率や過剰在庫の割合など、複数の要素をもとに総合的に判断されます。
より具体的には、過去13週間における「1日の平均在庫容積」を「1日の平均出荷容積」で割った『在庫保管スペースの使用比率』をもとに算定されます。簡単に言えば、「現在の販売ペースで全在庫を売り切るのに何週間かかるか」という指標で、この値が大きいほど追加手数料が高くなる仕組みです。
戦略的に在庫を多めに持つケースもありますが、在庫パフォーマンスが悪化すると、保管超過手数料という形で直接的なコスト増につながります。この手数料はAmazon側からの「在庫最適化を求めるシグナル」とも言えるため、IPIを定期的に確認し、在庫設計やSKU構成を見直すことが、安定したFBA運用には欠かせません。
低在庫レベル手数料（2024年5月導入の新しい手数料）
低在庫レベル手数料は、2024年5月から導入された比較的新しい手数料で、商品の需要に対して在庫が少ない小型・標準サイズの商品に適用されます。「過剰在庫を抱えるとコストが増える」という従来の方向性に対し、この手数料は『在庫切れリスクのある商品』を対象とする点が特徴です。
つまり、Amazonは出品者に対して「過剰でも過小でもない、適正在庫量の維持」を求めているということです。法人セラーは、SKUごとに需要予測を行い、需要に対して適切な在庫水準を保つ運用設計が一層重要になっています。
関連記事：FBA配送を活用したAmazon販売のコツ｜注意点や手数料の計算方法も紹介
【最新料金表】Amazon FBA在庫保管手数料の計算方法と具体例
Amazon FBA保管料を正確に把握するためには、計算式と料金単価を理解しておくことが必要です。ここでは、月額在庫保管手数料の計算式、商品サイズ・時期別の料金単価、そして実際の商品を例にした計算例を整理します。
FBA在庫保管手数料の基本計算式
FBA在庫保管手数料は、商品の販売価格や重量ではなく、「商品サイズ（体積）」と「保管日数」をもとに算出されます。基本となる計算式は以下の通りです。
月額基準金額 ×（商品サイズ㎤ ÷ 1,000㎤）×（保管日数 ÷ 当月の日数）
つまり、商品3辺の体積を「10cm×10cm×10cm（＝1,000㎤）」で割った数に月額基準金額を掛け、それを保管日数で日割り計算するという仕組みです。基準金額は商品サイズと時期によって異なります。
商品サイズ・時期別の料金単価（2026年最新）
FBA在庫保管手数料の月額基準金額は、商品サイズ区分（小型・標準／大型・特大型）と時期（1〜9月の通常期／10〜12月の繁忙期）によって設定されています。代表的な単価の目安は以下の通りです（10cm×10cm×10cmあたり）。
- 小型・標準サイズ・通常期（1〜9月）：おおむね5〜6円台/月
- 小型・標準サイズ・繁忙期（10〜12月）：おおむね10円台/月
- 大型・特大型サイズ・通常期（1〜9月）：おおむね4〜5円台/月
- 大型・特大型サイズ・繁忙期（10〜12月）：おおむね9〜10円台/月
- 服&ファッション小物・シューズ&バッグ：上記とは別の料金体系
料金単価は2025年5月の改定以降、さらに段階的な見直しが行われています。最新の正確な金額は必ずAmazonセラーセントラルの公式料金ページで確認するようにしましょう。
計算例：小型商品をFBAに30日保管した場合
例として、商品サイズが「縦15cm×横10cm×高さ5cm（＝750㎤）」の小型商品を、1月（31日）の1か月間FBA倉庫に保管した場合の手数料を計算してみましょう。月額基準金額を5.5円と仮定します。
5.5円 ×（750㎤ ÷ 1,000㎤）×（31日 ÷ 31日）＝ 約4.13円/個・月
仮にこの商品を200個保管すると、月額の在庫保管手数料は約826円となります。一見少額に見えても、複数SKUを大量に展開する法人セラーでは積み上がるとまとまった金額になり、繁忙期はこの数字がほぼ2倍になる点に注意が必要です。
服・シューズ・バッグカテゴリは別料金体系
「服&ファッション小物」「シューズ&バッグ」カテゴリは、上記とは別の料金体系が適用されます。サイズ区分による細かな違いがなく一律料金となっているため、アパレル系を扱う事業者は別途確認が必要です。
自社の取扱商品がどのカテゴリに分類されるかを確認したうえで、それぞれの料金表で計算するようにしましょう。
セラーセントラルでAmazon FBA保管料を確認する方法
Amazon FBA保管料を正確に管理するためには、セラーセントラル上で数値を定期的に確認することが欠かせません。感覚的な把握ではなく、請求額や対象在庫をデータとして把握することで、無駄な保管コストの早期発見につながります。
ここでは、月額保管料や長期在庫、在庫パフォーマンスを確認する具体的なポイントを整理します。
月額FBA保管料の請求額を確認する手順
月額FBA保管料の請求額は、セラーセントラルの支払い関連レポートから確認できます。具体的な確認手順は以下の通りです。
- セラーセントラルにログインし、上部メニューから「レポート」→「フルフィルメント」を選択
- 左側メニューの「支払い／ペイメント」セクションから、「FBA在庫保管手数料」レポートを選択
- 対象期間を指定して「.csv形式でのダウンロードをリクエスト」をクリック
- ダウンロードしたCSVで、ASIN単位・SKU単位の保管料明細を確認
また、FBA在庫レポートを併用することで、SKU単位やASIN単位でどの商品がどれだけ保管料を発生させているかを確認することも可能です。
規模が拡大してくるにつれ、取扱SKU数が多くなりやすいため、全体の請求額だけを見るのではなく、保管料負担の大きい商品を特定する視点が重要です。月次で数値を確認し、想定よりも保管料が増えている場合は、在庫量や補充頻度を見直す判断材料として活用することが求められます。
なお、月額在庫保管手数料は「毎月7日〜15日の間に前月分が計算され、翌月の決済時に請求される」仕組みです。月初に確認しても請求額は反映されないため、月の中旬以降にチェックする習慣をつけましょう。
長期在庫保管手数料の対象商品を特定する方法
長期在庫保管手数料の対象商品は、セラーセントラル内の在庫健全性レポートやFBA在庫年齢レポートから確認できます。これらのレポートでは、在庫の保管日数ごとに商品が分類されており、271日以上滞留している在庫を容易に特定できます。
重要なのは、すでに手数料が発生している在庫だけでなく、今後対象になり得る在庫を事前に把握することです。万人向けではないニッチ商品は販売サイクルが長くなりやすいため、判断が遅れると保管料負担が急増します。定期的にレポートを確認し、返送や処分、販路切り替えを検討するタイミングを早めることが、コスト抑制につながります。
在庫パフォーマンス指標（IPI）の確認ポイント
在庫パフォーマンス指標（IPI）は、FBA在庫管理の健全性を示す重要な数値です。セラーセントラルの在庫パフォーマンスダッシュボードから確認でき、在庫回転率や過剰在庫の割合などをもとにスコアが算出されます。
IPIが低下すると、FBA在庫保管容量が制限される可能性があります。さらに、制限を超える在庫を保管した場合には在庫保管超過手数料が発生するため、IPIは単なる参考値ではなく、在庫戦略やキャッシュフローにも直結する重要な指標として管理する必要があります。
FBA料金シミュレーターでAmazon FBA保管料を試算する手順
FBA料金シミュレーターは、Amazonが無料で提供している公式ツールで、保管料を含むFBA関連手数料と利益率を商品単位で試算できます。新規商品の出品判断や、補充判断、価格戦略の見直しに不可欠なツールです。ここでは具体的な使い方を解説します。
FBA料金シミュレーターの基本的な使い方
FBA料金シミュレーターは、ASIN・SKU・商品名のいずれかを検索窓に入力するだけで、対象商品のFBA手数料を自動計算してくれます。具体的な手順は以下の通りです。
- Amazonセラーセントラルにログインし、ヘルプ画面から「FBA料金シミュレーター」を開く（または検索窓で「料金シミュレーター」と検索）
- 検索窓に対象商品のASINまたはSKU、商品名を入力して検索
- 「販売価格」「商品原価」「Amazonまでの配送料」など必要項目を入力
- 「計算」ボタンをクリックすると、販売手数料・FBA配送代行手数料・1か月分のFBA在庫保管手数料・利益額・利益率が自動算出される
自社発送（FBM）と比較した利益額・利益率も同時に表示されるため、FBAを使うべきか自己発送にすべきかの意思決定にも活用できます。
FBA料金シミュレーターを使う際の3つの注意点
便利なツールですが、以下の点には注意して使う必要があります。
①シミュレーター上の保管料は『1か月分』のみが計算される：実際には複数月にわたって保管される商品が多いため、回転日数を踏まえて手動で乗算する必要があります
②サイズ計測の差で実際の手数料がブレる：シミュレーターは登録寸法ベースで計算しますが、Amazon側で実測されると区分が変わるケースがあります
③長期在庫追加手数料は反映されない：271日以上保管した場合の追加手数料は別途見積もる必要があります
これらを踏まえ、シミュレーター結果を「最低ラインの試算」と捉え、繁忙期上乗せや長期保管リスクを織り込んで補正することが、実務では重要になります。
Amazon FBA保管料を抑えるための在庫管理戦略（考え方）
Amazon FBA保管料を抑えるためには、個別の対処に頼るのではなく、在庫管理全体の考え方を整理することが重要です。売上だけでなく、在庫回転率や保管期間を意識した設計を行うことで、保管料を固定費としてコントロールできます。
ここでは、在庫管理の基本戦略を解説します。
在庫回転率を基準にSKUを定期的に見直す
在庫管理において重要な指標の一つが在庫回転率です。在庫回転率が低い商品は、売上に対して保管料負担が大きくなり、利益を圧迫する原因となります。戦略的にSKUを増やすケースもありますが、すべてのSKUが同じ役割を持つわけではありません。
定期的に在庫回転率を確認し、主力SKUと補助的なSKUを切り分けることで、在庫構成を最適化できます。回転率の低い商品については、補充量の調整や取り扱い継続の是非を検討するなど、数値に基づいた判断が重要です。
長期滞留在庫は早期に返送・処分を検討する
長期間売れていない在庫は、保管料を発生させ続ける要因となります。特にFBAでは、271日を超えると長期在庫保管手数料が発生するため、判断の先送りはコスト増につながります。
「将来的な取引機会」のことを考え、在庫を残しがちですが、実際にはキャッシュフローを圧迫しているケースも少なくありません。一定期間売れ行きがない在庫については、返送や処分、他販路への切り替えを含めて早期に判断することが、保管料を抑えるための重要な戦略となります。
FBA料金シミュレーターで事前に保管コストを把握する
FBA料金シミュレーターは、新規商品や補充時の保管コストを事前に把握するための有効なツールです。商品サイズや想定在庫量を入力することで、月額保管料を含めたコスト感を把握できます。
事前シミュレーションを行わずに納品すると、想定以上の保管料が発生するリスクがあります。シミュレーターを活用し、売上・粗利と保管コストのバランスを確認したうえで在庫計画を立てることが、安定したFBA運用につながります。
関連記事：Amazon販売で儲ける！利益計算の基本と、利益を最大化する5つの秘訣
FBA保管料を最小化するための5つの実践プロセス（具体策）
FBA保管料を抑えるためには、場当たり的な対応ではなく、日常運用の中に改善プロセスを組み込むことが重要です。在庫状況を定期的に可視化し、判断基準を明確にすることで、無駄な保管コストを継続的に削減できます。
ここでは、実務で実行しやすい5つの具体的なプロセスを整理します。
在庫パフォーマンス指標を定期的にチェックし改善につなげる
在庫パフォーマンス指標（IPI）は、FBA在庫管理の状態を総合的に示す重要な指標です。IPIを定期的に確認することで、過剰在庫や回転率低下といった課題を早期に把握できます。
重要なのは、スコアの高低だけで判断せず、内訳となる指標を確認することです。IPIが低下している場合は在庫構成が現在の売上規模に適していない可能性があります。改善ポイントを明確にし、補充量の調整やSKU整理を行うことで、保管料増加を防ぐことができます。
長期間滞留している在庫は早期に整理・判断する
長期間FBA倉庫に滞留している在庫は、売上を生まないまま保管料だけを発生させる要因となります。特に271日を超えると長期在庫保管手数料の対象となるため、判断の先送りはコスト負担を大きくします。
一定期間売れ行きがない在庫については、返送や処分、販路切り替えを含めた整理を早期に行うことが、保管料最小化の基本となります。
一定期間動きのない商品は利益率とキャッシュフローで見極める
在庫の継続保有を判断する際は、「いつか売れるだろう」ではなく、利益率とキャッシュフローの観点から評価することが重要です。売上が発生していない期間でも、保管料は毎月発生するため、実質的な利益率は時間とともに低下します。
粗利率が高い商品であっても、回転が遅ければ資金が固定化され、他の成長投資に回せなくなります。一定期間動きのない商品については、今後の売上見込みと保管コストを比較し、継続保有か整理かを数値で判断することが、健全な在庫運用につながります。
【在庫最適化①】価格調整によって在庫回転を優先する
在庫を整理する手段の一つとして、価格調整によって在庫回転を高める方法があります。短期的に利益率が下がる場合でも、在庫を早期に現金化することで、保管料の発生を止める効果が期待できます。
重要なのは、値下げそのものではなく、在庫回転を優先するという判断です。保管料が積み重なる前に価格戦略を見直し、回転率を改善することで、トータルで見た収益性を高めることが可能になります。
【在庫最適化②】返送や販路切り替えで在庫を圧縮する
価格調整でも回転が見込めない場合は、在庫をFBA倉庫から返送し、他の販路へ切り替える選択肢も検討すべきです。返送によってFBA保管料の発生を止めることで、固定費化していたコストを抑えられます。
自社ECや卸、法人向け販売など複数の販路を持つケースも多く、FBAに固執しない柔軟な判断が重要です。在庫を圧縮し、資金を再配分することで、全体の事業効率を高めることにつながります。
関連記事：AmazonFBA納品のやり方7ステップ｜必要なものや注意点も解説
Amazon FBA保管料に関するよくある質問（FAQ）
ここでは、Amazon FBA保管料について法人セラーから特に多く寄せられる質問にお答えします。日々の在庫管理判断やコスト試算の際にご活用ください。
Q1. FBA保管料はいつ請求されますか？
月額在庫保管手数料は、毎月7日〜15日の間に前月分が計算され、翌月の決済時に請求されます。たとえば1月分の保管料は、2月7日〜15日のトランザクションに記録され、2月のペイメントレポートで確認可能です。長期在庫追加手数料は毎月15日時点の在庫が評価対象となります。
Q2. 月の途中で商品が売れた場合、保管料はどう計算されますか？
FBA保管料は日割り計算されます。たとえば1月15日に売れた商品は、1月1日〜15日の15日分のみが当月の保管料計算に含まれます。そのため、回転の早い商品ほど月額の保管料は実質的に少なくなります。
Q3. 保管料は商品の販売価格や重量で変わりますか？
変わりません。FBA在庫保管手数料は『商品サイズ（体積）』と『保管日数』のみで決まります。販売価格や重量は配送代行手数料には影響しますが、保管料には直接関係しません。そのため、軽くても体積の大きい商品（クッション、ぬいぐるみなど）は意外と保管料が高くなる傾向があります。
Q4. 自社倉庫と比べてFBA保管料は割高ですか？
一般的にはFBA保管料の単価は自社倉庫より高めです。ただし、FBAには配送代行・カスタマー対応・Prime対象化によるCVR向上といったメリットがあるため、単純比較ではなく『売上拡大効果＋業務効率化＋保管料』を含めたトータルコストで判断する必要があります。回転の遅いSKUのみを自社倉庫に切り分けるハイブリッド運用も有効です。
Q5. 長期在庫追加手数料を回避するにはどうすればよいですか？
271日が一つのボーダーラインとなるため、180〜200日経過時点を「警告ライン」として設定し、価格見直し・セール出品・返送・廃棄のいずれかを判断することが基本対策です。さらに、初回納品時から「販売ペースに合った数量」を心がけ、過剰納品をしないことが最も効果的な予防策となります。
Q6. 服やシューズの保管料は他カテゴリと違うのですか？
はい、異なります。「服&ファッション小物」「シューズ&バッグ」カテゴリは、サイズ区分による細かな違いがなく一律料金が適用される独自の料金体系となっています。アパレル系を扱う事業者は、Amazonセラーセントラルの公式ページで該当料金表を必ず確認しましょう。
まとめ｜Amazon FBA保管料の理解は利益改善へ
Amazon FBA保管料は、単なる運用コストではなく、在庫設計や資金繰りに大きな影響を与える要素です。特に企業がAmazonを活用する場合、売上拡大だけでなく、保管料を含めたコスト管理が利益改善の鍵となります。
保管料の仕組みや確認方法を理解し、計算式・料金単価を踏まえたうえで、在庫回転率や在庫パフォーマンスを基準に判断することで、無駄なコストを抑えた運用が可能になります。加えて2024年以降に新設された『在庫保管追加手数料』『低在庫レベル手数料』、2025年に改定された『長期在庫追加手数料』など、保管コスト関連の制度は年々複雑化しているため、定期的な情報アップデートも欠かせません。
FBA保管料を正しく管理することは、Amazon事業を中長期で成長させるための重要な経営判断と言えるでしょう。
FORCE-RではAmazonの在庫戦略・FBA保管料の最適化を含めた運用支援を法人セラー向けに提供しています。「保管料が想定より膨らんでいる」「IPIが低く保管超過手数料が発生してしまう」といった課題がある方は、お気軽にご相談ください。
